Avec l'arrivée de la peste bubonique à Minorque, le roi Charles III ordonna la construction du Lazaret en 1793, conçu comme un complexe sanitaire pour la quarantaine des malades. Auparavant, les Britanniques avaient construit un établissement similaire sur l'île de la Quarantaine. Il a commencé à fonctionner en 1817 et a cessé de fonctionner comme lazaret à la fin du XIXe siècle, étant ensuite réutilisé pour des congrès et des réunions.
Déclaré Bien d'Intérêt Culturel en 1993, le Lazaret se trouve dans un emplacement privilégié au centre du port de Mahon, préservant son patrimoine historique et architectural.